Sur les sites de Saint-Ghislain et d'Hautrage, l'Institut Saint-Joseph organise l'enseignement fondamental et secondaire. L'enseignement secondaire comporte trois types d'enseignement : géneral, technique et professionnel.
Fidèles à l'action entamée depuis toujours par leurs fondatrices, les responsables veillent à donner les mêmes chances d'émancipation à tous les élèves. L'objectif est de donner à chacun la possibilité de s'épanouir personnellement et de prendre une place active dans la vie économique, sociale et culturelle.
L'attention est également mise sur l'esprit de tolérance et d'ouverture sur le monde afin de former des citoyens responsables, capables de contribuer au développement d'une société démocratique fondée sur le respect de l'autre.